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(19)中华 人民共和国 国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202111401463.5 (22)申请日 2021.11.19 (71)申请人 浙江大学 地址 310058 浙江省杭州市西湖区余杭塘 路866号 (72)发明人 张红河 陈超一 来茂德  (74)专利代理 机构 北京金智普华知识产权代理 有限公司 1 1401 代理人 皋吉甫 (51)Int.Cl. C12N 15/113(2010.01) A61K 31/7088(2006.01) A61P 35/00(2006.01) A61P 35/04(2006.01) A61P 1/00(2006.01) (54)发明名称 靶向环状RNA cir cRHOBTB3的反义寡核苷酸 及在结直肠癌治 疗中的应用 (57)摘要 本发明设计并合成了靶向circRHOBTB3的 ASO药物, 可以有效提高cir cRHOBTB3在细胞中的 水平。 用所述ASO处理结直肠癌细胞以及动物肿 瘤转移模型后, 有效抑制了结直肠癌细胞在体外 的增殖、 迁移和侵袭以及在体内的转移, 为恶性 肿瘤的治 疗提供了一条途径。 权利要求书1页 说明书5页 序列表1页 附图3页 CN 113980967 A 2022.01.28 CN 113980967 A 1.一种circRHOBTB3的反义寡核苷酸ASO序列ASO ‑cir, 其可以通过靶向circRHOBTB3的 环化元件, 阻碍抑制性剪接因子的结合从而提高circRHOBTB3表达水平, 所述的ASO ‑cir包 含如下序列: 5' ‑ GUUGCCTGAAGATTCATGGCUAGCA   ‑3'; 优选的, 所述的ASO ‑cir由序列5' ‑   GUUGCCTGAAGATTCATGGCUAGCA  ‑3'组成。 2.根据权利要求1所述的ASO ‑cir, 其特征在于, 所述的ASO ‑cir被修饰, 所述的修饰包 括但不限于5 ’及3’各5个碱基2 ’‑OMe修饰, 全链硫代磷酸酯键修饰, 模式为 MMMMMDDDDDDDDDDDDDDDMMMMM, 其中M代表2 ’ ‑OMe修饰的RNA, D表示未修饰的DNA, 各碱基或 碱基类似物由硫代磷酸酯键连接 。 3.一种circRHOBTB3的反义寡核苷酸ASO序列ASO ‑exo, 其可以通过靶向分泌调控元件, 抑制circRHOBTB3的外泌体分选从而提高circRHOBTB3表达水平; 所述ASO ‑exo包含如下序 列: 5'‑UAGCAAAAAGATCCTGGGTAGUUCG ‑3', 优选的, 所述的ASO ‑exo由序列5' ‑ 5'‑ UAGCAAAAAGATCCTGGGTAGUUCG‑3'组成。 4.根据权利要求3所述的更有选 的ASO‑exo, 其特征在于, 所述的ASO ‑exo被修饰, 所述 的修饰包括但不限于5 ’及3’各5个碱基2 ’ ‑OMe修饰, 全链硫代磷酸酯键修饰, 模式为 MMMMMDDDDDDDDDDDDDDDMMMMM, 其中M代表2 ’ ‑OMe修饰的RNA, D表示未修饰的DNA, 各碱基或 碱基类似物由硫代磷酸酯键连接 。 5.一种可提高circRHOBTB3表达的组合物, 包括了权利要求1或2中所述的ASO ‑cir以及 药学上可接受的载体。 6.一种可提高circRHOBTB3表达的组合物, 包括了权利要求3或4 中所述的ASO ‑exo以及 药学上可接受的载体。 7.一种可提高circRHOBTB3表达的组合物, 包括了权利要求1或2中所述的ASO ‑cir、 权 利要求3或4中所述的ASO ‑exo以及药 学上可接受的载体。 8.权利要求1或2所述的AS O‑cir在制备抑制癌症药物中的应用, 优选的, 所述的癌症为 结直肠癌。 9.权利要求3或4所述的AS O‑exo在制备抑制癌症药物中的应用, 优选的, 所述的癌症为 结直肠癌。 10.权利要求5 ‑7任一项所述的组合物在制备抑制癌症药物中的应用, 优选的, 所述的 癌症为结直肠癌。权 利 要 求 书 1/1 页 2 CN 113980967 A 2靶向环状RNA  circRHOBTB3的反义寡核 苷酸及在结直肠癌治 疗中的应用 技术领域 [0001]本发明属于分子生物学领域, 涉及ASO药物的设计及应用。 具体来说, 本发明针对 人circRHOB TB3的环化及分泌调控 元件序列分别设计合成了两条反义寡核苷 酸ASO, 通过促 进circRHOBTB3以及抑制circRHOBTB3的外泌体分选从而提高其细胞内表达, 所述ASO可在 体内外抑制结直肠癌细胞的生长和转移。 背景技术 [0002]环状 RNA (circRNA) 是非编码  RNA 重要成员之一; 不同于线性长链非编码  RNA (lncRNA) , circRNA  主要由 RNA 聚合酶 II 转录产生的前体  RNA 通过反向剪接产生的一 类不具有  5'末端帽子和  3'末端 poly(A) 尾巴结构, 却以共价键形成闭环结构的环状   RNA 分子。 。 circRNA参与调控一系列的疾病过程, 如心血管疾病、 神经系统疾病、 代谢性疾 病和肿瘤等疾病的发生和发展。 尤其在肿瘤中通过高通量测序技术筛选已经鉴定出大量与 肿瘤密切相关的  circRNA。 [0003]circRHOBTB3  是其母基因  RHOBTB3 第 6 和第 7 外显子背靠背反向剪接环化产 生, 目前有文献报道circRHOBTB3  的生物学功能通过分子海绵作用吸附  miR‑654‑3p 和调 控 PI3K/AKT  信号通路, 从而抑制胃癌和卵巢癌进展。 我们的前期实验也证明circRHOBTB3 可以通过别的机制抑制结直肠癌的进 展。 [0004]侵袭和转移是恶性肿瘤最普遍的生物学特征, 也是影响患者生存和预后的关键因 素, 结直肠癌不仅发病率高且在中晚期极易 发生转移, 成为治疗失败的主要原因。 目前并未 有针对circRHOBTB3的反义寡核苷酸 (Antisense  Oligonucleotide, ASO) 的产品及其在抑 制结直肠癌发生发展中的应用的相关研究。 发明内容 [0005]为了弥补现有技术中的不足, 本发明设计并合成了靶向circRHOBTB3的ASO药物, 可以有效提高circRHOBTB3在细胞中的水平。 用所述ASO处理结直肠癌细胞以及动物肿瘤转 移模型后, 有效抑制了结直肠癌细胞在体外的增殖、 迁移和侵袭以及在体内的转移, 为恶性 肿瘤的治疗提供了一条途径。 [0006]本发明的一个方面是提供circRHOBTB3的反义寡核苷酸ASO序列ASO ‑cir, 其可以 通过靶向circRHOBTB3的环化元件, 阻碍抑制性剪接因子的结合 从而提高circRHOBTB3表达 水平, 所述的ASO ‑cir包含如下序列: 5' ‑ GUUGCCTGAAGATTCATGGCUAGCA   ‑3', 优选的, 所述 的ASO‑cir由序列5' ‑ GUUGCCTGAAGATTCATGGCUAGCA   ‑3'组成。 在一个具体的实施例中, 所 述的ASO‑cir被修饰, 所述的修饰包括但不限于5 ’及3’各5个碱基2 ’ ‑OMe修饰, 全链硫代磷 酸酯键修饰, 模式为MMMMMDDDDDDDDDDDDDDDMMMMM, 其中M代表2 ’ ‑OMe修饰的RNA, D表示未修 饰的DNA, 各碱基 (碱基 类似物) 由硫代磷酸酯键连接 。 [0007]本发明的第二个方面提供circRHOBTB3的反义寡核苷酸ASO序列ASO ‑exo, 其可以说 明 书 1/5 页 3 CN 113980967 A 3

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专利 靶向环状RNA circRHOBTB3的反义寡核苷酸及在结直肠癌治疗中的应用 第 1 页 专利 靶向环状RNA circRHOBTB3的反义寡核苷酸及在结直肠癌治疗中的应用 第 2 页 专利 靶向环状RNA circRHOBTB3的反义寡核苷酸及在结直肠癌治疗中的应用 第 3 页
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